１．出售、收购、利用国家二级保护水生野生动物或者其产品的许可

２．出售、收购、利用国家一级保护水生野生动物的审核

３．国家二级保护水生野生动物捕捉许可

４．国家一级保护野生水生动物捕捉审核

５．建购动力在12马力以上的机动捕捞渔船许可

６．进入地方级水生野生动植物自然保护区核心区开展科研、调查观测活动的许可

７．进入地方级水生野生动植物自然保护区试验区开展参观、旅游活动的许可

８．进入国家级水生野生动植物自然保护区核心区进行科研、调查观测的审核

９．进入国家级水生野生动植物自然保护区实验区参观、旅游的审核

１０．签署与地方级水生野生动植物保护区有关的涉外协议许可

１１．签署与国家级水生野生动植物保护区有关的协议审核

１２．省外渔民渔业捕捞许可

１３．水产苗种进、出口许可

１４．水生、野生动物或其产品出口审核

１５．水生野生动物进口审核

１６．水生野生动物携带、运输的许可

１７．天然水域及通江湖泊引种许可

１８．外国人进入地方级水生野生动植物自然保护区的许可

１９．外国人进入国家级水生野生动植物自然保护区的审核

２０．外国人进行与水生野生动物保护有关活动的审核

２１．驯养繁殖国家二级保护水生野生动物许可

２２．驯养繁殖国家一级保护水生野生动物许可

２３．渔船船员的考核

２４．渔港内装卸危险货物、渔港设施建设及相关施工、捕捞、养殖作业的许可

２５．渔业捕捞许可

２６．渔业船舶初次检验

２７．渔业船舶登记

２８．渔业船舶临时检验

２９．渔业船舶营运检验

３０．原、良种场水产苗种生产许可